《龙樱2》改编自三田纪房的同名漫画，故事发生在2005年剧版《龙樱》的10年后，讲述从龙山高中退休后一直指导私立大学经营的樱木建二(阿部宽饰)，接受了再次陷入困境的龙山高中的邀请，回来带领学生奋斗。前作中扮演学生水野直美的长泽雅美，也将以教师身份重返母校。

"在宇宙的最远最深处，有一座神秘的山谷，这座山谷的名字叫：巨龙山谷。巨龙山谷里有着各种神秘而伟大的种族，生活着各式各样的神奇生物，却从未有过人类踏足，这里每一天都是阳光灿烂的。 人类小孩安豆出生在跨越星河的星际飞船上，一场意外让她出现在了这座神秘的山谷。在巨龙山谷里，安豆认识了各类其他的宇宙生物：火及火鸟，哇哒西咕，车车人，铁鸟，数字游鱼，小板凳，大眼仔，大头鱼，胭脂鱼，坏坏猫，鲨鱼弟等，开始了她在巨龙山谷的成长冒险故事。 "

民国时期，千灯镇出现一位冻龄奇人柴胡，传闻他的体内有龙栖息。记者魏雨彤拍下奇人的照片，引发了她作为生物学家的父亲魏以山的注意。魏以山带领团队来到千灯镇找到柴胡，发现他痴傻不已，就以柴胡的妻子要挟他带领团队前往有龙传说的八百山，山中危机四伏，一场寻龙的冒险就此拉开帷幕......