1991年，香港黑帮三合会会员刘健明听从老大韩琛的吩咐，加入警察部队成为黑帮卧底，韩琛许诺刘健明会帮其在七年后晋升为见习督察。1992年，警察训练学校优秀学员陈永仁被上级要求深入到三合会做卧底，终极目标是成为韩琛身边的红人。2002年，两人都不负重望，也都身背重压，刘健明渐想成为一个真正的好人，陈永仁则盼着尽快回归警察身份。 重案组从陈永仁手中获悉一批毒品交易情报，锁紧目标人物韩琛，没料情报被刘健明泄出，双方行动均告失败。但此事将双方均有卧底的事实暴露，引发双方高层清除内鬼的决心。命运迥异又相似的刘健明和

传说远古一段不为人知的时期，正气衰竭，人类自命比天高，正气被遗弃，大地之神为警戒世人决定爆发一次大灾难，并引发起天崩地裂，被封锁于黑暗地下的妖魔亦乘机出动，在人间尽情破坏……就在这混乱昏暗之期，只有神剑门门主无间道人可以跟妖魔决一死战。因为无间道的灭魔圣剑能够灭魔斩妖，灭魔圣剑是神剑门先师以天外黑铁，倾毕生心血铸练而成，由于用剑者到最后都会人尽灯灭，故将剑与剑诀《天外飞仙》分开埋藏。童年时的三个好友：小错、小逆、小云，分别被道界魔界仙界收养，培养为无间、莫逆、圣女，三人命运一夕被改变，天下苍生命运的改变亦

1991年18岁的三合会会员刘建明听从大哥韩琛的指示进入警校学习，想得到机会来做警方的卧底。而同时警校中的另一名学生陈永仁，受警方安排表面上将其强迫退学，实际上则是让他进入三合会当卧底。刘建明从警校毕业后顺利的进入警局，并且职位步步高升，已成为刑事情报科A队的一员，在此期间他利用各种机会为韩琛提供了大量的情报。而陈永仁在这些年以来已经得到了韩琛的初步信任。

1991年，香港黑帮龙头倪坤被杀，倪氏家族旗下五大头目中除韩琛外，均伺机背叛发难，不料却被倪家不起眼的第二代倪永孝不费一兵一卒牵制，此举引来重案祖督察黄志诚的戒心，使其派出警校学生陈永仁渗入倪家进行长期的卧底工作，而韩琛为了巩固势力，早在警察内部安插了线人刘建明。三年后，事业蒸蒸日上的倪永孝为安枕无忧，决意将五大头目一举歼灭，却因疏忽让韩琛成为漏网之鱼。1997年，大难不死的韩琛重出江湖，为替死去的同事报仇，黄志诚找到他商议合作除掉倪永孝的事宜，不久却发现此举铸成大错，而各自为自己的尴尬身份苦恼的陈永仁和